Η πρώτη φάση αντιμετώπισης της περιοδοντίτιδας περιλαμβάνει τις υποουλικές αποξέσεις. Κατά τη φάση αυτή χωρίς χειρουργική επέμβαση αφαιρείται η μικροβιακή πλάκα και η πέτρα που βρίσκεται στους θύλακες γύρω από τα δόντια και οι ρίζες των δοντιών λειαίνονται. Το στόμα απαλλάσσεται έτσι από τα παθογόνα μικρόβια και τους υπόλοιπους βλαπτικούς παράγοντες. Κατά συνέπεια, τα ούλα σφίγγουν και επαναπροσφύονται στα δόντια με αποτέλεσμα την εξαφάνιση των θυλάκων. Καθημερινή σωστή στοματική υγιεινή θα διατηρήσει αυτό το θεραπευτικό αποτέλεσμα.
Περισσότερο προχωρημένες μορφές περιοδοντίτιδας μπορεί να απαιτήσουν σε δεύτερη φάση χειρουργική θεραπεία. Η χειρουργική θεραπεία εκτός από τα παραπάνω στοχεύει στην ανάπλαση νέου οστού για την καλύτερη στήριξη των δοντιών καθώς και στη δημιουργία τέτοιων μορφολογικών συνθηκών ώστε να διευκολύνεται η απομάκρυνση της μικροβιακής πλάκας με την καθημερινή στοματική υγιεινή.
Μετά τη θεραπεία οι ασθενείς ελέγχονται ανά τακτά χρονικά διαστήματα για λόγους πρόληψης επανεμφάνισης της νόσου. Εδώ αξίζει να σημειωθεί ότι τίποτα δεν διασφαλίζει καλύτερα τη διατήρηση του θεραπευτικού αποτελέσματος από το σωστό καθημερινό βούρτσισμα των δοντιών καθώς και την άσκηση άλλων μεθόδων στοματικής υγιεινής.